Một trong những đặc điểm chính của khí hậu chính trị của nước cộng hòa là vị trí của Giáo hội Công giáo La Mã và mức độ tự chủ cho các bang liên bang. Năm 1839, một cuộc tranh chấp nảy sinh qua việc đóng cửa các tu viện của Quốc hội New Granada. Điều này nhanh chóng leo thang vào cuộc chiến tranh của những người Supremes, đã nổ ra trong hai năm tới và biến thành một cuộc xung đột về quyền tự trị khu vực.

New Granada đã được chuyển đổi vào năm 1858 cho Liên minh Granadine như một câu trả lời cho các yêu cầu cho một quốc gia phi tập trung.